Optimalizace izolace plazmidové DNA z autochtonních bakteriálních kultur získaných z reálných vzorků kontaminované podzemní vody

Simple item page
dc.contributor.advisorDolinová Iva, Mgr. Ph.D. :64092cs
dc.contributor.authorMařas, Filipcs
dc.contributor.refereeMarková Kristýna, Mgr. :69252cs
dc.date.accessioned2024-12-16T06:24:43Z
dc.date.available2024-12-16T06:24:43Z
dc.date.committed22.5.2023cs
dc.date.defense28.8.2024cs
dc.date.issued2024-08-28
dc.date.submitted10.10.2022cs
dc.description.abstractBakalářská práce se zaměřuje na optimalizování metod izolace plazmidové DNA u bakterií degradujících chlorované uhlovodíky. Cílem práce je vyzkoušení standardizovaných a vlastních postupů izolace. Bakteriální vzorky jsou získány z nanovlákenných nosičů a filtrací podzemní vody z vrtů kontaminovaných lokalit. Plazmidová DNA je extrahována komerčními izolačními kity. Měření probíhá amplifikační metodou polymerázové řetězové reakce v reálném čase. Výsledky experimentální části práce ukazují, že použití standardních postupů komerčně dostupných izolačních kitů je nedostatečné, jelikož extrahují veškerý genetický materiál. Řešení nabízí aplikace enzymu exonukleázy, jenž odstraní lineární chromozomální DNA, zatímco kružnicovou plazmidovou DNA zachová.cs
dc.description.abstractThe bachelor thesis focuses on optimizing methods for isolating plasmid DNA in bacteria degrading chlorinated hydrocarbons. The aim of the thesis is to evaluate standardized and custom isolation procedures. Bacterial samples are obtained from nanofiber carriers and filtration of groundwater from wells at contaminated sites. Plasmid DNA is extracted using commercial isolation kits. Measurement is conducted using the real-time polymerase chain reaction (PCR) amplification method. The results of the experimental part of the thesis indicate that the use of standard procedures with commercially available isolation kits is inadequate because they extract all genetic material. The solution involves the application of the exonuclease enzyme, which removes linear chromosomal DNA while preserving circular plasmid DNA.en
dc.format66 s.cs
dc.identifier.urihttps://dspace.tul.cz/handle/15240/176014
dc.language.isoCScs
dc.subjectbakteriecs
dc.subjectDNAcs
dc.subjectplazmidycs
dc.subjectchlorované uhlovodíkycs
dc.subjectextrakční kitycs
dc.subjectpolymerázová řetězová reakcecs
dc.subjectamplifikacecs
dc.subjectspektrofotometriecs
dc.subjectelektroforézacs
dc.subjectmarkercs
dc.subjectexonukleázacs
dc.titleOptimalizace izolace plazmidové DNA z autochtonních bakteriálních kultur získaných z reálných vzorků kontaminované podzemní vodycs
dc.titleOptimization of plasmid DNA isolation from autochthonous bacterial cultures obtained from real samples of contaminated groundwateren
dc.typediplomová prácecs
local.degree.abbreviationBakalářskýcs
local.identifier.authorP20000395cs
local.identifier.stag45403cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
Bakalářská práce (Filip Mařas).pdf
Size:
8.92 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
VŠKP ( 10.7.2024 23:52 )
Download
Thumbnail Image
Name:
Filip Mařas_BP_oponent_Kristýna Marková.pdf
Size:
156.34 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek oponenta VŠKP ( 2.8.2024 15:45 )
Download
Thumbnail Image
Name:
BP_vedouci-maras.pdf
Size:
155.13 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek vedoucího VŠKP ( 23.8.2024 15:58 )
Download
Collections
Fakulta přírodovědně-humanitní a pedagogická